Tuy nhiên, ECC Cần Thơ cho rằng, để công tác TKNL ở Cần Thơ đạt kết quả tốt hơn nữa rất cần sự hỗ trợ của Bộ Công Thương, UBND TP. Cần Thơ về chủ trương, nguồn lực cho việc hình thành ngay ít nhất là 01 đơn vị có đủ điều kiện tư vấn, nâng cao nhận thức về hoạt động TKNL và kiểm toán năng lượng cho các doanh nghiệp sản xuất công nghiệp, các tòa nhà cao tầng, các trường học, các công ty xây dựng và các đơn vị quản lý chiếu sáng công cộng. Bởi, kiểm toán năng lượng đòi hỏi kiến thức rất rộng, nhưng hiện nay không có trường đại học nào đào tạo chuyên sâu về lĩnh vực này. Khi thực hiện một tư vấn về kiểm toán năng lượng, kiểm toán viên cần 3 nền tảng kiến thức: Nhiệt lạnh; Điện; Kiến trúc và xây dựng. Trung tâm TKNL Cần Thơ còn thiếu nguồn nhân lực có chuyên môn sâu về TKNL, cần có thời gian để hoàn chỉnh nghiệp vụ.
Một khó khăn nữa đó là ý thức về lợi ích của TKNL ở các doanh nghiệp trên địa bàn chưa cao, gây khó khăn cho việc tiếp cận, đặc biệt trong việc triển khai thực hiện các giải pháp TKNL có vốn đầu tư lớn như thay thế và đổi mới dây chuyền công nghệ, thiết bị. Vì vậy, ECC Cần Thơ cho rằng cần tăng cường hỗ trợ các doanh nghiệp thực hiện các dự án TKNL; Xây dựng các giải pháp đồng bộ về chính sách, kỹ thuật nhằm ứng dụng rộng rãi công nghệ và kinh nghiệm quản lý sử dụng năng lượng hiệu quả, nâng cao hiệu quả sản xuất tại các doanh nghiệp trên địa bàn TP. Cần Thơ, qua đó nâng cao trình độ công nghệ và tính cạnh tranh của ngành công nghiệp và dịch vụ của Thành phố…